Međunarodni centar za podvodnu arheologiju u Zadru osnovan je 2007. g. u sastavu HRZ-a, a ubrzo je, u skladu s međunarodnim ugovorom potpisanim između UNESCO-a i RH 2009. g., postao samostalna javna ustanova te dobio status UNESCO-ovog centra II kategorije. Upravljanje i financiranje centra i njegovih aktivnosti uglavnom provode RH i UNESCO.
Vizija Međunarodnog centra za podvodnu arheologiju u Zadru je očuvanje i promoviranje podvodne kulturne baštine Hrvatske, Sredozemlja i Europe.